Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXQ3

LINC01599, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01599, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01599Q8WXQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC01599Q8WXQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC01599Q8WXQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LINC01599Q8WXQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LINC01599Q8WXQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms