Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGARPQ8TDB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms