Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBA3Q8TBC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA3Q8TBC4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBA3Q8TBC4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms