Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO27Q8NI29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO27Q8NI29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms