Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYRIPQ8NFW9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYRIPQ8NFW9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYRIPQ8NFW9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms