Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP35Q8NFH5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUP35Q8NFH5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms