Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC44A5Q8NCS7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC44A5Q8NCS7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC44A5Q8NCS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC44A5Q8NCS7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms