Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDPRQ8NCN5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDPRQ8NCN5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms