Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF169Q8NCN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF169Q8NCN4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF169Q8NCN4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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