Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRC57Q8N9N7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC57Q8N9N7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms