Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPM1NQ8N819 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPM1NQ8N819 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms