Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUD6BQ8N6M0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTUD6BQ8N6M0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUD6BQ8N6M0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms