Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF10Q8N5U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF10Q8N5U6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF10Q8N5U6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms