Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAG2Q8N3U4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAG2Q8N3U4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAG2Q8N3U4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms