Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf40Q8IXQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf40Q8IXQ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf40Q8IXQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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