Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC103Q8IW40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms