Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC50Q8IVM0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC50Q8IVM0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms