Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3FQ8IUX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
APOBEC3FQ8IUX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3FQ8IUX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms