Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFNL1Q8IU54 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFNL1Q8IU54 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms