Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PALB2Q86YC2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PALB2Q86YC2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms