Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBBP6Q7Z6E9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBBP6Q7Z6E9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBBP6Q7Z6E9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms