Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX9Q7RTT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms