Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTOP3Q7RTS5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTOP3Q7RTS5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms