Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00173Q6ZV60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00173Q6ZV60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms