Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00299Q6ZSB3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00299Q6ZSB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms