Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEACAM20Q6UY09 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEACAM20Q6UY09 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms