Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C19orf48Q6RUI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C19orf48Q6RUI8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C19orf48Q6RUI8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms