Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOA5Q6Q788 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
APOA5Q6Q788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOA5Q6Q788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms