Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AAGABQ6PD74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AAGABQ6PD74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AAGABQ6PD74 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms