Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC70Q6NSX1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC70Q6NSX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC70Q6NSX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms