Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCSD1Q6JBY9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RCSD1Q6JBY9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms