Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MCTP1Q6DN14 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCTP1Q6DN14 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCTP1Q6DN14 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCTP1Q6DN14 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms