Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM200BQ69YZ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM200BQ69YZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM200BQ69YZ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms