Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GGNBP1Q5YKI7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms