Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUSD4Q5VX71 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUSD4Q5VX71 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SUSD4Q5VX71 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms