Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM208BQ5VWN6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM208BQ5VWN6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM208BQ5VWN6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM208BQ5VWN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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