Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C1orf53Q5VUE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C1orf53Q5VUE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
C1orf53Q5VUE5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms