Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GKAP1Q5VSY0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GKAP1Q5VSY0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GKAP1Q5VSY0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms