Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SYT6Q5T7P8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYT6Q5T7P8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYT6Q5T7P8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms