Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDLRAD1Q5T700 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDLRAD1Q5T700 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDLRAD1Q5T700 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms