Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
COL5A1-AS1Q5SY13 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL5A1-AS1Q5SY13 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms