Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX1Q5SQQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX1Q5SQQ9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX1Q5SQQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms