Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf38Q5JPI3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf38Q5JPI3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf38Q5JPI3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms