Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MS4A13Q5J8X5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A13Q5J8X5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A13Q5J8X5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms