Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNDC3AQ59EK9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUNDC3AQ59EK9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3AQ59EK9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms