Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TAF1BQ53T94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1BQ53T94 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1BQ53T94 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms