Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ANKRD39Q53RE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ANKRD39Q53RE8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD39Q53RE8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms