Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSD17B12Q53GQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSD17B12Q53GQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms