Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SBK1Q52WX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SBK1Q52WX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SBK1Q52WX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SBK1Q52WX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms