Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A12Q504Y0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A12Q504Y0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC39A12Q504Y0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC39A12Q504Y0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms